Naruto Ninja Council 3 — это ролевая приключенческая игра, в которой история параллельна аниме. История основана на аниме-сериале с некоторыми новыми функциями. Геймплей похож на две предыдущие игры серии, в которых участвуют Наруто против ниндзя. Игроки также могут настраивать своего персонажа с помощью различных костюмов, оружия и предметов. В игре для Nintendo DS есть в общей сложности 8 игровых персонажей, в том числе: Наруто Узумаки, Саске Учиха, Сакура Харуно, Сай Учиха, Шизуне Хирузен, Ино Яманака и Чоджи Акимичи.
